Jepang di masa depan mengalami bencana besar yang tidak dapat dijelaskan. Lima tahun kemudian, rekonstruksi berjalan dengan baik. Dua peneliti muda di sebuah universitas menggantungkan harapan mereka pada pengembangan robot. Inilah kisah sebelum sang pahlawan lintas masa, Astro Boy, terlahir!
Atom The Beginning
Lima tahun telah berlalu sejak terjadinya Bencana Besar yang membawa kehancuran cukup besar. Rekonstruksi dan inovasi teknologi untuk menanggulangi dampak dari kejadian tersebut menjadikan robot memiliki tepat tersendiri di tengah-tengah masyarakat. Para robot melakukan berbagai pekerjaan yang diprogram oleh manusia mulai dari pekerjaan sehari-hari hingga pembangunan kota pasca Bencana Besar dengan sempurna tanpa kegagalan sedikitpun. Hal ini membuat robot menjadi sesuatu yang tak tergantikan bagi hidup manusia. Meski demikian robot bukanlah manusia karena mereka tidak memiliki hati. Dua mahasiswa dari Universitas Nerima, Tenma Umetarou dan Ochanomizu Hiroshi tengah berusaha untuk mengembangkan sebuah robot. Di Lab nomor 7 yang berada di ujung kampus, mereka berusaha membuat robot dengan sistem Bewusstein, sistem yang mampu membuat robot memiliki hati dan kesadaran sendiri. Kelak robot yang mereka namakan sebagai A106 ini adalah robot yang akan dikenal luas sebagai Atom.