Setelah melarikan diri dari bus pembajakan dengan bantuan superhero bertopeng Jus Aneh, Yuuta Iridatsu menemukan jiwanya terpisah dari tubuhnya dan dalam perawatan roh kucing sesat, Chiranosuke. Sebagai roh, Yuuta berkeliaran di sekitar kediamannya, Rumah Korai, bertujuan untuk mendapatkan kembali tubuhnya dan mengamati penghuni lainnya: Meika Daihatsu, seorang penemu jenius; Mikatan Narugino, idola yang ceria; Ito Hikiotani, NEET yang tertutup; dan Rabura Chichibu, media spiritual. Setelah melihat sekilas pakaian dalam Narugino, Chiranosuke mengungkapkan kepada Yuuta bahwa ia menjadi lebih kuat secara eksponensial setelah melihat celana dalam. Namun, jika dia melihat pasangan lain saat dia masih semangat, kekuatannya akan menyebabkan asteroid menabrak bumi, mengakhiri dunia dan membunuh teman-temannya.
Punch Line mengikuti Yuuta saat ia mengungkap misteri di sekitar Korai House, penghuninya, dan organisasi jahat yang berusaha mengakhiri dunia. Akankah Yuuta dapat menyelamatkan semua orang, atau akankah ancaman celana dalam yang selalu ada akan mengakibatkan malapetaka?
