Tomoya Okazaki adalah penjahat yang menemukan kehidupan yang membosankan dan percaya bahwa dia tidak akan pernah berarti apa-apa. Bersama dengan temannya, Youhei Sunohara, ia bolos sekolah dan berencana membuang hari-hari sekolah menengahnya.
Suatu hari ketika berjalan ke sekolah, Tomoya melewati seorang gadis muda bergumam pelan pada dirinya sendiri. Tanpa peringatan dia berseru “Anpan!” (makanan Jepang yang populer) yang menarik perhatian Tomoya. Dia segera menemukan nama gadis itu adalah Nagisa Furukawa dan bahwa dia berseru hal-hal yang dia sukai untuk memotivasi dirinya sendiri. Nagisa mengklaim mereka sekarang berteman, tapi Tomoya berjalan pergi melewati pertemuan itu sebagai tidak ada.
Namun, Tomoya menemukan dia semakin memperhatikan Nagisa di sekitar sekolah. Akhirnya dia mengakui dan berteman dengannya. Tomoya belajar Nagisa telah menahan satu tahun karena penyakit parah dan bahwa mimpinya adalah untuk menghidupkan kembali klub drama sekolah. Mengklaim dia tidak ada yang lebih baik untuk dilakukan, dia memutuskan untuk membantunya mencapai tujuan ini bersama dengan bantuan empat gadis lain.
Ketika Tomoya menghabiskan lebih banyak waktu dengan gadis-gadis itu, dia belajar lebih banyak tentang mereka dan masalah mereka. Ketika dia mencoba untuk membantu setiap gadis mengatasi hambatannya masing-masing, dia mulai menyadari bahwa kehidupan tidak semulus yang pernah dia pikirkan.
