Suatu hari, sebuah UFO besar berputar di Jepang dan menabrak tanah pertanian di luar Nagaoka, mengganggu kehidupan biasa Tsubasa Misudachi. Sebagai Gatchaman, pembela legendaris Kota Tachikawa, mengawasi cobaan itu, makhluk asing yang damai muncul dari pesawat ruang angkasa. Dalam kekacauan berikutnya, Tsubasa diberikan notebook berteknologi tinggi khusus, atau CATATAN, dari pendiri Gatchaman J.J. Robinson, menandakan perekrutan tiba-tiba Tsubasa ke dalam kelompok mereka. Di bawah bimbingan sesama pahlawan Hajime Ichinose, Tsubasa perlahan mulai menyesuaikan diri dengan kehidupan sebagai pembela keadilan.
Sementara itu, teknologi CROWDS, yang memungkinkan pengguna untuk mewujudkan kesadaran mereka ‘menjadi bentuk fisik, menyebar di antara publik, serta didukung oleh Perdana Menteri Sugayama. Namun, sebuah organisasi misterius yang dikenal sebagai VAPE telah mendapatkan ketenaran dengan menggunakan warna merah unik untuk membuat kekacauan, mengubah opini publik terhadap teknologi CROWDS. Gatchaman, bersama dengan rekrutan baru Tsubasa, harus menghentikan kegiatan merusak mereka sebelum terlambat.